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Arte antica:

• Musei Capitolini
• Medagliere Capitolino
• Palazzo dei Conservatori
• Palazzo Nuovo
• Pinacoteca Capitolina
• Tabularium
• Centrale Montemartini
• Mercati e Foro di Traiano
• Museo dell'Ara Pacis
• Museo Barracco
• Museo della Civiltà Romana
• Museo delle Mura
• Villa di Massenzio

Storia:

• Museo di Roma a Palazzo Braschi
• Museo Napoleonico
• Museo di Roma in Trastevere

Arte moderna e contemporanea:

• Museo di arte contemporanea (MACRO) nelle sue due sedi:
• Ex stabilimento industriale Peroni
• Ex mattatoio di Testaccio
• Museo Carlo Bilotti
• Museo Pietro Canonica
• Musei di Villa Torlonia:
• Casina delle Civette
• Casino Nobile
• Casino dei Principi

Scienza:

• Museo Civico di Zoologia
• Planetario e Museo Astronomico

Arte antica e medievale

• Antiquarium del Casale di Malborghetto
• Antiquarium del Palatino
• Antiquarium della Villa dei Quintili
• Galleria Nazionale di Arte Antica:
• Palazzo Barberini
• Palazzo Corsini
• Mausoleo di Cecilia Metella
• Museo Archeologico dell'Auditorium
• Museo delle Antichità Etrusco Italiche
• Museo dell'Arte Classica
• Museo delle Navi Romane
• Museo Nazionale dell'Alto Medioevo
• Museo Nazionale dell'Arte Orientale
• Museo Nazionale Etrusco di Villa Giulia
• Museo Nazionale di Palazzo Venezia
• Museo Nazionale Romano nelle sue sedi:
• Aula Ottagona
• Crypta Balbi
• Palazzo Altemps
• Palazzo Massimo alle Terme
• Terme di Diocleziano
• Museo Ostiense
• Museo di via Ostiense
• Museo del Vicino Oriente
• Musei Vaticani

Scienza e tecnologia

• Banca di Roma - Sala espositiva dell'Archivio Storico
• Museo della Banconota della Banca d'Italia
• Museo delle Cere
• Museo Didattica
• Museo della Moneta della Banca d'Italia
• Museo Nazionale delle Paste Alimentari
• Museo Numismatico della Zecca Italiana
• Museo di ricordi di San Vincenzo Pallotti
• Parco Museo ferroviario Met.Ro Roma Porta San Paolo

Tecnologia

• Città della Scienza
• Ecomuseo del Litorale Romano - Polo Ostiense
• Explora - Museo del Bambini
• Museo di Anatomia Comparata Battista Grassi
• Museo di Anatomia Patologica
• Museo Anatomico Eugenio Morelli
• Museo di Antropologia Giuseppe Sergi
• Museo dell'Arte Farmaceutica
• Museo Astronomico Copernicano
• Museo di Chimica
• Museo Criminologico
• Museo della Didattica della Scienza
• Museo di Fisica
• Museo di Idraulica
• Museo dell'Istituto centrale di Patologia del Libro "Alfonso Gallo"
• Museo Laboratorio della Mente
• Museo di Merceologia
• Museo Merceologico delle Dogane
• Museo Multipolare della Scienza e dell'Informazione Scientifica di Roma (MUSIS)
• Museo Nazionale Preistorico ed Etnografico Luigi Pigorini
• Museo di Paleontologia
• Museo di Storia della Medicina
• Museo Storico Nazionale dell'Arte Sanitaria
• Museo della Strumentazione e Informazione Cristallografica
• Museo di Zoologia e Anatomia Comparata
• Spezieria di Santa Maria della Scala